۱. مفهوم و هویت طراحی
موزه با زیربنایی حدود ۲۴۰۰ متر مربع و فرم صدف‌مانند بتنی، بازتابی از فرهنگ صیادی و مروارید جزیره کیش است. این نماد معماری، مانند نمایی از هویت جزیره، در ذهن بازدیدکنندگان جای می‌گیرد .
۲. فضاهای نمایشگاهی و گالری‌ها
در موزه، پنج گالری تخصصی وجود دارد که شامل «بازار سنتی»، «آزادسازی هرمز»، «صید و صیادی»، «باستان‌شناسی»، و «دوره‌های تاریخی تا پارینه‌سنگی» است. برخی از این گالری‌ها همراه با سنسورهای صوتی، تجربه‌ای زنده از تاریخ ارائه می‌دهند
۳. کارکردهای تکمیلی
علاوه بر نمایش آثار، این مجموعه دارای آمفی‌تئاتر، سینما، کافی‌شاپ، کارگاه‌های هنری، فروشگاه و پیست دوچرخه‌سواری است که آن را به فضای فرهنگی-تفریحی جامع تبدیل می‌کند .
۴. تحلیل اقلیمی و نمادسازی معماری
طراحی ساده داخلی با غالب رنگ سفید، علاوه بر زیبایی، حس پاکی را تقویت می‌کند و سازه صدف‌مانند با ارتفاع ۵۲ متر، برجسته و قابل شناسایی است. موزه در نزدیکی بافت تاریخی حریره و ساحل مرجانی قرار دارد که اهمیت فرهنگی آن را افزایش می‌دهد.
۵. دیدگاه سایت مرجع معماری ایران
به نقل از وب‌سایت نقش برتر پارس:
«این مجموعه نمادی موفق از هم‌نشینی معماری مدرن و فرهنگ بومی جزیره کیش است و توانسته با طراحی تامل‌برانگیز خود، جایگاه فرهنگی جزیره را ارتقا دهد.»
— سایت مرجع معماری ایران (نقش برتر پارس)